Проверьте остатки товаров в программе ЮТД по данным отчётов:
... далее в других отчетах
Остатки нужно проверять на день раньше даты начала отправки документов в бухгалтерию в разделе "Настройка и администрирование" -> "Синхронизация данных" -> "Синхронизация данных".
Например, если дата отправки документов с 01.01.2023, то остатки нужно просматривать с 31.12.2022 г. в отчёте "Остатки товаров на складах"
Проблемы могут быть связаны с неправильным созданным документом "Ввод начальных остатков", т.к. он должен быть внесён в программу датой ранее начала отправки документов в программу бухгалтерии.
Дополнительно нужно учитывать действие галки "Оформить движения датой документа оприходования/продажи" в документе "Ввод начальных остатков", если галка установлена, то все документы оприходования и продажи должны быть ранее даты начала отправки документов в программу бухгалтерии.